Luigi Ricciardi 1 ، روزا مازیو 2,*©، اینجلو راffaele Marcotrigiano 1 , Guglielmo Rainaldi 3 , Paolo Iovieno 4 ، وٹو زونو 1 ، سٹیفانو پاون 1© اور Concetta Lotti 2,*
- 1 ڈیپارٹمنٹ آف سوائل، پلانٹ اینڈ فوڈ سائنسز، پلانٹ جینیٹکس اور بریڈنگ یونٹ یونیورسٹی آف باری، ویا ایمنڈولا 165/A، 70125 باری، اٹلی؛ luigi.ricciardi@uniba.it (LR)؛angelo.marcotrigiano@uniba.it (ARM)؛ vito.zonno@uniba.it (VZ)؛ stefano.pavan@uniba.it (ایس پی)
- 2 شعبہ زراعت، خوراک اور ماحولیات، یونیورسٹی آف فوگیا، ویا ناپولی 25، 71122 فوگیا، اٹلی
- 3 بایو سائنسز، بایو ٹیکنالوجیز اور بایو فارماسیوٹیکلز کا شعبہ، یونیورسٹی آف باری، ویا اورابونا 4، 70125 باری، اٹلی؛ guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 محکمہ توانائی ٹیکنالوجیز، بایو انرجی، بائیو ریفائنری اور گرین کیمسٹری ڈویژن، ENEA Trisaia Research Center, SS 106 Ionica, km 419+500, 75026 Rotondella (MT), Italy; paolo.iovieno@enea.it
* مطابقت: rosa.mazzeo@unifg.it (RM)؛ concetta.lotti@unifg.it (CL)
خلاصہ:
پیاج (ایلیم سیپا ایل۔ اس کی اہم اقتصادی اہمیت اور فعال خوراک کے طور پر اس کی قدر کے باوجود، اس کے جینیاتی تنوع کے حوالے سے پیاز کی بہت کم تحقیق کی گئی ہے۔ اس کے ساتھ، ہم نے "Acquaviva red onion" (ARO) میں جینیاتی تغیرات کا سروے کیا، جو صوبہ باری (Apulia، جنوبی اٹلی کے جنوبی) کے ایک چھوٹے سے قصبے میں کاشت کی صدیوں پرانی تاریخ کے ساتھ ایک لینڈریس ہے۔ 11 مائیکرو سیٹلائٹ مارکرز کا ایک سیٹ 13 ARO آبادیوں اور تین عام تجارتی اقسام پر مشتمل ایک جراثیمی مجموعہ میں جینیاتی تغیرات کو تلاش کرنے کے لیے استعمال کیا گیا تھا۔ پیرامیٹرک اور نان پیرامیٹرک طریقوں کے ساتھ جینیاتی ڈھانچے کے تجزیوں نے اس بات پر روشنی ڈالی کہ ARO ایک اچھی طرح سے متعین جین پول کی نمائندگی کرتا ہے، جو واضح طور پر Tropea اور Montoro landraces سے مختلف ہے جس کے ساتھ اکثر غلطی کی جاتی ہے۔ بلب کی تفصیل فراہم کرنے کے لیے، جو عام طور پر تازہ استعمال کے لیے استعمال کیے جاتے ہیں، حل پذیر ٹھوس مواد اور تپش کا جائزہ لیا گیا، جو کہ مذکورہ بالا دو لینڈریسز کے حوالے سے اے آر او میں زیادہ مٹھاس کو ظاہر کرتا ہے۔ مجموعی طور پر، موجودہ مطالعہ ARO کی مستقبل کی قدر کاری کے لیے مفید ہے، جسے معیاری لیبلز کے ذریعے فروغ دیا جا سکتا ہے جو تجارتی فراڈ کو محدود کرنے اور چھوٹے ہولڈرز کی آمدنی کو بہتر بنانے میں معاون ثابت ہو سکتا ہے۔
تعارف
ایلیم جینس میں تقریباً 750 انواع شامل ہیں [1]، جن میں پیاز (Allium cepa L., 2n = 2x = 16) سب سے زیادہ پھیلی ہوئی ہے۔ A. cepa کا ایک دو سالہ دور ہوتا ہے اور تولیدی رویے کو باہر کر دیتا ہے۔ آج کل، پیاز کی عالمی پیداوار (97.9 Mt) اسے ٹماٹر کے بعد دوسری اہم ترین سبزیوں کی فصل بناتی ہے [2]۔ پرانے زمانے سے، پیاز کے بلب کو کھانے کے طور پر اور لوک دواؤں کے استعمال میں استعمال کیا جاتا رہا ہے۔ درحقیقت، قدیم مصریوں نے پہلے ہی 1550 قبل مسیح کے ایک طبی پیپرس، کوڈیکس ایبرس [3] میں لہسن اور پیاز کے استعمال پر مبنی کئی علاج کے فارمولوں کی اطلاع دی تھی۔
یہ ورسٹائل اور صحت بخش سبزی کچی، تازہ، یا پروسیسڈ پروڈکٹ کے طور پر کھائی جاتی ہے، اور بہت سے پکوانوں کے ذائقے کو بڑھانے کے لیے استعمال ہوتی ہے۔ کئی حالیہ مطالعات میں دعویٰ کیا گیا ہے کہ پیاز کا استعمال قلبی امراض [4,5]، موٹاپا [6]، ذیابیطس [7]، اور کینسر کی مختلف شکلوں [8-10] کے خطرے کو کم کر سکتا ہے۔ پیاز کی صحت کی خصوصیات کو اکثر نیوٹراسیوٹیکل مرکبات کی دو قسموں کی اعلیٰ سطحوں سے منسوب کیا جاتا ہے: فلاوونائڈز اور الک(en)yl cysteine sulphoxides (ACSOs)۔ پہلی کلاس میں فلاوونلز اور اینتھوسیانز شامل ہیں۔ Quercetin اہم پتہ لگانے والا flavonol ہے، جو فری ریڈیکل اسکیوینجنگ اور ٹرانزیشن میٹل آئنز بائنڈنگ میں مضبوط اینٹی آکسیڈینٹ اور سوزش مخالف خصوصیات کے لیے جانا جاتا ہے۔ ہے [11]; جبکہ اینتھوسیانز پیاز کی کچھ اقسام کو سرخ/جامنی رنگ دیتے ہیں۔ جہاں تک ACSOs کا تعلق ہے، سب سے زیادہ پرچر isoalliin [(+)-trans-S-1-propenyl-L-cysteine سلفوکسائڈ] ہے۔ ہے [12]، خلیات میں ذخیرہ شدہ ایک غیر مستحکم اور غیر پروٹینوجینک سلفر امینو ایسڈ، جو پیاز کی تیز خوشبو اور ذائقہ کے لیے بالواسطہ ذمہ دار ہے۔ ہے [13]. بافتوں میں خلل پڑنے پر، isoalliin کو انزائم alliinase کے ذریعے کلیو کر دیا جاتا ہے تاکہ غیر مستحکم مرکبات (pyruvate، ammonia، thiosulphonates اور propanethial S-oxide) کی ایک سیریز پیدا کی جا سکے جو پھٹنے کا باعث بنتے ہیں اور ناخوشگوار بو (تیزی) کا باعث بنتے ہیں۔ ہے [14]. پیاز کی تپش کو اکثر تازہ وزن کے فی گرام، ہائیڈولیسس کے ذریعے پیدا ہونے والے پائروک ایسڈ کی مقدار کے طور پر ماپا جاتا ہے۔ [1516 XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX].
بحیرہ روم کے طاس کے ممالک میں، ثانوی تنوع کے مراکز میں سے ایک کے طور پر تجویز کردہ اے سیپا [1718 XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX]، پیاز کے بلب شکل، سائز، رنگ، خشک مادے، اور تپش میں وسیع تغیرات دکھاتے ہیں۔ [19-ایک]. مزید برآں، سلفر پر مبنی فرٹیلائزیشن، زرعی طریقوں، مٹی کی قسم، موسمی حالات، اور کھیتی یا لینڈریس کی جینوٹائپ مخصوص آرگنولیپٹک اور غذائیت کی قدروں کو عطا کر کے بلب کے معیار کو متاثر کر سکتی ہے۔ [23-ایک]. اٹلی میں، پیاز کے جراثیم کی وسیع دستیابی کے باوجود، پیاز کی صرف چند اقسام کو اکثر سائنسی مطالعہ کا نشانہ بنایا جاتا ہے اور ان کی صحیح خصوصیات ہوتی ہیں۔ [2829 XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX،XNUMX].
پودوں کے جینیاتی وسائل کے مناسب تحفظ کو یقینی بنانے اور ویلیو چین میں مخصوص جین ٹائپس کے استعمال کو فروغ دینے کے لیے زرعی حیاتیاتی تنوع کی مکمل جینیاتی اور فینوٹائپک خصوصیات بہت اہم ہیں۔ [30-ایک]. سادہ سیکوینس ریپیٹ (SSR) مارکر اکثر نقشہ سازی کے لیے چنے جاتے ہیں۔ [33-ایک]، ڈی این اے فنگر پرنٹنگ اور فصلی امتیاز [36-ایک]، اور لینڈریسس کے اندر اور ان کے درمیان جینیاتی تغیر کا قابل اعتماد تخمینہ [39-ایک]چونکہ وہ لوکس مخصوص، ملٹی ایللیک، کوڈومیننٹ طور پر وراثت میں ملے، انتہائی قابل تولید، اور خودکار جین ٹائپنگ کے لیے موزوں ہیں۔
موجودہ مطالعہ میں، ہم نے اپنی توجہ ایک Apulian روایتی لینڈریس، "Acquaviva red onion" (ARO) پر مرکوز کی، جس کی کاشت باری صوبے کے قصبے Acquaviva delle Fonti کے ایک چھوٹے سے علاقے میں نامیاتی کاشتکاری کے طریقوں کے مطابق کی جاتی ہے۔ (اپولیا، جنوبی اٹلی)۔ اس لینڈریس کے بلب بڑے اور چپٹے اور سرخ رنگ کے ہوتے ہیں اور زیادہ تر مقامی ترکیبوں میں استعمال ہوتے ہیں۔ اگرچہ اے آر او نے "سلو فوڈ پریسیڈیم" کوالٹی مارک حاصل کیا، لیکن اس کی پیداوار کو یورپی یونین کے معیار کے نشانات جیسے کہ محفوظ جغرافیائی اشارے (PGI) اور اصل کے محفوظ عہدہ (POD) کے ذریعے مزید فروغ اور تحفظ دیا جا سکتا ہے، کیونکہ یہ اس کی پیداوار کو محدود کرنے میں معاون ثابت ہو سکتے ہیں۔ تجارتی فراڈ اور چھوٹے ہولڈرز کی آمدنی میں بہتری۔ اس کے ساتھ ساتھ، ایس ایس آر مالیکیولر مارکر کو طاقتور ٹولز کے طور پر استعمال کیا گیا تاکہ اے آر او آبادیوں میں جینیاتی تغیرات کا اندازہ لگایا جا سکے اور اس لینڈریس کو دیگر دو جنوبی اطالوی سرخ پیاز کے لینڈریسز سے امتیاز کیا جا سکے۔ مزید برآں، ہم نے مارکیٹ کی طلب کے سلسلے میں اے آر او کے ذائقے کا اندازہ لگانے کے لیے تپش اور حل پذیر ٹھوس مواد کا تخمینہ لگایا۔
نتائج کی نمائش
Acquaviva Red Onion Germplasm مجموعہ اور مورفولوجیکل خصوصیات کا قیام
اے آر او لینڈریس کی 13 آبادیوں کے بیج، جو کاشتکاروں کی طرف سے بائیو ڈائیورس او اپولیا ریجن پروجیکٹ کے فریم ورک میں عطیہ کیے گئے تھے، کو اے آر او جراثیمی مجموعہ قائم کرنے کے لیے استعمال کیا گیا۔
بلب، جلد اور گوشت سے متعلق مورفولوجیکل ڈسکرپٹرز اے آر او جرمپلازم اور پیاز کے تین لینڈریسز پر جمع کیے گئے تھے، دو کا تعلق "ٹروپیا ریڈ اوئن" (TRO) لینڈریس سے اور ایک کا تعلق "مونٹورو کاپر اونین" (MCO) لینڈریس سے ہے۔ 1). تمام اے آر او بلب فلیٹ تھے اور ان کی خصوصیات سرخ بیرونی جلد اور سرخ رنگ کے مختلف شیڈز کے ساتھ تھے۔ اس کے برعکس، TRO بلب کا گوشت مکمل طور پر سرخ تھا، جبکہ MCO بلب کا گوشت خراب رنگت والا تھا (ٹیبل S1)۔ بائیو کیمیکل تجزیہ کو ٹھوس گھلنشیل مواد اور تپش کا اندازہ کرنے کی اجازت ہے۔ جیسا کہ ٹیبل میں رپورٹ کیا گیا ہے۔ 1, ARO آبادیوں میں بلب کے ٹھوس حل پذیر مواد کی اوسط قدریں 7.60 تھیں، اور یہ 6.00 (ARO12) سے 9.50° Brix (ARO11 اور ARO13) تک تھیں۔ یہ قدر TRO اور MCO لینڈریسز (بالترتیب 4.25 اور 6.00° Brix) کے تخمینہ سے زیادہ تھی۔
ٹیبل 1. "Acquaviva Red Onion" (ARO)، "Tropea Red Onion" (TRO)، اور "Montoro Copper Onion" (MCO) آبادیوں میں ٹھوس حل پذیر مواد اور تیز رفتار قدروں کا اندازہ *۔
CODE | حل پذیر ٹھوس مواد (برکس) | تیکھی (pmolg-1 ایف ڈبلیو) | ||
مطلب | CV y (٪) | مطلب | CV y (٪) | |
اے آر او 1۔ | 6.25 ڈی * | 5.65 | 5.84 ab* | 23.78 |
اے آر او 2۔ | 7.25 DC۔ | 4.87 | 6.51 ایک | 22.98 |
اے آر او 3۔ | 7.50،XNUMX،XNUMX بی سی ڈی | 9.42 | 5.28 اب | 22.88 |
اے آر او 4۔ | 7.50،XNUMX،XNUMX بی سی ڈی | 0.00 | 6.97 ایک | 3.74 |
اے آر او 5 | 7.50،XNUMX،XNUMX بی سی ڈی | 0.00 | 6.80 ایک | 9.68 |
اے آر او 6۔ | 6.25 D | 5.65 | 4.51 اب | 39.18 |
اے آر او 7۔ | 7.25 DC۔ | 4.87 | 5.25 اب | 15.44 |
اے آر او 8۔ | 9.00 AB | 0.00 | 7.04 ایک | 3.49 |
اے آر او 9۔ | 8.25 اے بی سی | 4.28 | 6.84 ایک | 0.15 |
اے آر او 10۔ | 7.00 DC۔ | 0.00 | 5.94 اب | 6.57 |
اے آر او 11۔ | 9.50 A | 7.44 | 5.54 اب | 16.43 |
اے آر او 12۔ | 6.00 D | 0.00 | 4.91 اب | 9.70 |
اے آر او 13۔ | 9.50 A | 7.44 | 6.63 ایک | 24.93 |
ایڈمنسٹریشن کنٹرول آفس | 6.00 D | 0.00 | 4.18 اب | 2.66 |
TRO1 | 4.25 E | 8.31 | 2.80 بی | 2.10 |
TRO2 | 4.25 E | 8.31 | 4.28 اب | 4.79 |
* بالترتیب 0.01P یا 0.05P (SNK's Test) میں ایک جیسے حروف والے بڑے یا چھوٹے حروف والے مطلب اعدادوشمار کے لحاظ سے مختلف نہیں ہیں۔ y مختلف حالتوں کے گتانک.
اے آر او پنگینسی کی اوسط قدر، جس کا اندازہ پائروک ایسڈ کے مواد کے ذریعے کیا گیا، 6.00 تھا، جو 4.51 pmol g سے لے کر تھا۔-1 FW (ARO6) سے 7.04 (ARO8)۔ یہ قدر TRO اور MCO لینڈریسز (3.54 pmol g-1 FW اور 4.18 pmol g-1 FW، بالترتیب)۔
SSR پولیمورفزم اور الحاق کے درمیان جینیاتی تعلقات
موجودہ مطالعہ میں، 11 میں سے 37 ٹیسٹ شدہ SSR پرائمر کے امتزاج نے سنگل لوکس پولیمورفزم فراہم کیے، یعنی ایک فرد میں زیادہ سے زیادہ دو ایمپلیفیکیشن مصنوعات حاصل کرنا۔ مجموعی طور پر، 55 (ACM320 اور ACM 2) سے لے کر 147 (ACM504) سے لے کر 11 ایللیس (ٹیبل) کی اوسط قیمت کے ساتھ 132 افراد میں 5 ایللیس کا پتہ چلا۔ 2). انفرادی آبادی میں، ایللیس (Na) کی تعداد 1.94 (ACM147 اور ACM504) سے 5.38 (ACM132) تک تھی، جب کہ ایللیس کی مؤثر تعداد (Ne) 1.41 (ACM152) سے 2.82 (ACM449) تک تھی۔ تضادات Na اور Ne اقدار کے درمیان آبادی میں کم تعدد والے ایللیس کی موجودگی اور صرف چند ایللیس کی برتری کی وجہ سے تھی۔ سب سے زیادہ مشاہدہ شدہ heterozygosity (Ho) قدر ACM138 اور ACM449 (0.62) کے لیے نمایاں کی گئی تھی، جبکہ سب سے کم ایک ACM152 (0.25) سے وابستہ تھی۔ متوقع heterozygosity (He)، جو کہ panmictic آبادی میں نظریاتی توقع سے مطابقت رکھتا ہے، 0.37 (ACM504) سے 0.61 (ACM132، ACM138، اور ACM449) تک ہے۔ رائٹ کا فکسیشن انڈیکس (Fis)، تمام مارکروں کے لیے صفر (اوسط 0.05) کے قریب اقدار ظاہر کرتا ہے، جو مشاہدہ شدہ اور متوقع heterozygosity کی سطحوں کے درمیان یکساں اقدار کی نشاندہی کرتا ہے، جیسا کہ ایک آؤٹ کراسنگ پرجاتیوں کے لیے توقع کی جاتی ہے۔ جینیاتی فنگر پرنٹنگ میں انفرادی SSR مارکر کی کارکردگی کا اندازہ پولیمورفک انفارمیشن مواد (PIC) انڈیکس سے لگایا گیا تھا، جس کی اوسط قدر 0.48 تھی اور اس کی حد 0.33 (ACM504) سے 0.67 (ACM132) تھی۔ ایک اور کارکردگی کا اشاریہ، شینن کے انفارمیشن انڈیکس (I) نے اوسط قدر 0.84 ظاہر کی، اور فرض کی گئی قدریں 0.45 (ACM152) سے 1.20 (ACM132) تک ہیں۔
ٹیبل 2. ARO، TRO، اور MCO آبادیوں میں جینیاتی تنوع کا اندازہ لگانے کے لیے استعمال کیے جانے والے 11 SSR مارکروں کی پولیمورفزم کی خصوصیات۔ ایللیس کی کل تعداد (Na)، بینڈ سائز رینج، اور پولیمورفک انفارمیشن مواد (PIC) انڈیکس اس مطالعہ میں جین ٹائپ شدہ 320 افراد کے کل سیٹ کا حوالہ دیتے ہیں۔ ایللیس کی تعداد (Na)، موثر ایللیس کی تعداد (Ne)، مشاہدہ شدہ Heterozygosity (Ho)، متوقع Heterozygosity (He)، فکسیشن انڈیکس (F)is)، اور شینن کا انفارمیشن انڈیکس (I) 16 آبادیوں سے حساب کی گئی اوسط قدروں کا حوالہ دیتے ہیں، ہر ایک 20 افراد کے ذریعے مرتب کی گئی ہے۔
لوکس | کل Na | سائز کی حد (bp) | PIC | مطلب | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | 0.02- |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | 0.01- |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | 0.06- |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | 0.03- |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
مطلب | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
آبادیوں میں، ARO3، ARO6، ARO8، ARO10، TRO1، اور MCO نے اعلی درجے کی جینیاتی تغیر (Ho > 0.5) ظاہر کیا، جب کہ آبادی میں سب سے کم تنوع ARO7 (Ho = 0.27) (ضمنی جدول S2) میں دیکھا گیا۔ مجموعی طور پر، تمام لوازمات نے Fis صفر کے قریب اقدار (Fis اوسط قدر = 0.054)، جیسا کہ بے ترتیب ملاپ کے حالات میں متوقع ہے۔
مالیکیولر ویریئنس اور جینیاتی ڈھانچے کا تجزیہ
آبادیوں کے درمیان اور اس کے اندر جینیاتی تغیرات کی درجہ بندی کی تقسیم AMOVA کے ذریعہ کی گئی تھی۔ نتائج نے آبادی (87٪) کے اندر جینیاتی تغیرات کے کافی حصے کو اجاگر کیا۔ آبادی کے درمیان فرق، 13%، انتہائی اہم تھا (P <0.001) (ٹیبل 3). Fpt پیرامیٹر کی جوڑی کے لحاظ سے قدریں، رائٹ کے Fst فکسیشن انڈیکس کے مشابہ، 0.002 (ARO2/ARO10) سے لے کر 0.468 (ARO7/TRO2) تک، اہم تھیں (P <0.05)، سوائے نو جوڑے کے موازنہ کے (ضمنی جدول S3)۔
ٹیبل 3. کی 320 آبادیوں سے 16 جینوٹائپس کے مالیکیولر ویریئنس کا تجزیہ الیمیم سیپا L.
ماخذ | df | مربعوں کا مجموعہ | تغیر کا تخمینہ | تغیر (%) | Fpt | P |
آبادیوں کے درمیان | 15 | 458.63 | 1.16 | 13٪ | ||
آبادیوں کے اندر | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87٪ | 0.134 | 0.001 |
کل | 319 | 2731.62 | 8.66 |
میں جینیاتی ساخت کی تحقیقات اے سیپا اس مطالعے میں جین ٹائپ شدہ مجموعہ سافٹ ویئر اسٹرکچر میں لاگو کردہ مرکب ماڈل پر مبنی کلسٹرنگ تجزیہ کے ذریعہ انجام دیا گیا تھا۔ ایوانو اے کے طریقہ کار نے ہمارے لیے سب سے زیادہ معلوماتی کے طور پر دو کلسٹرز (K = 2) میں ذیلی تقسیم کی تجویز پیش کی۔ ڈیٹاسیٹ,ویں کے ساتھe اگلے سب سے زیادہ پیئak میں K = 5 (ضمیمہ Rgure S1). A کے لئے = 2، aHPopulations wپہلے گداigned to onاورf دو کلسٹرز ساتھ ایک rnernbertoip گتانک (q) > 0.7۔ جیسا کہ ایسhoمیں wn اعداد و شمار 2a، پہلے کلسٹر (جس کا نام S1 ہے) میں MCO اور تمام ARO آبادی شامل ہے، جبکہ S2 کلسٹر نے دو TRO آبادیوں کو گروپ کیا ہے۔ K = 5 پر، ڈیٹاسیٹ کی گہری تفصیل فراہم کرنا (شکل 2b)، 75% الحاق پانچ کلسٹر میں سے ایک کو تفویض کیے گئے تھے۔ ARO (S1) اور TRO (S2) کے درمیان علیحدگی کی تصدیق ہوگئی، حالانکہ کچھ ARO آبادیوں کو ملایا گیا تھا (q <0.7) یا دو نئے کلسٹر S3 اور S4 (ARO7 اور ARO12، بالترتیب) میں الگ الگ گروپ کیا گیا تھا۔ دلچسپ بات یہ ہے کہ MCO تجارتی قسم نے Apulian لال پیاز سے الگ ایک الگ کلسٹر (S5) تشکیل دیا۔
آبادی کے درمیان جینیاتی تعلقات
ایس ایس آر پولیمورفزم کو جینیاتی تنوع کا ڈینڈروگرام بنانے کی اجازت ہے اور فائیلوجنیٹک تجزیہ کے نتائج تصویر میں دکھائے گئے ہیں۔ 3a. یہاں، جراثیم کے ذخیرے کو پانچ گروپوں میں تقسیم کیا گیا تھا جس کی بوٹسٹریپ قدروں کی بھرپور حمایت کی گئی تھی۔ ARO7 اور ARO12 آبادیوں کو فوری طور پر بقیہ آبادیوں سے الگ کر دیا گیا اور دو الگ الگ کلسٹر بنائے گئے۔ تیسرے کلسٹر میں TRO کی دو تجارتی آبادی شامل تھی، اسی دوران چوتھے نوڈ نے MCO کو گیارہ ARO آبادیوں سے تقسیم کیا۔ پرنسپل کوآرڈینیٹ تجزیہ (پی سی او اے) (شکل) کے ذریعہ آبادی کے درمیان پائے جانے والے جینیاتی تعلقات کی مزید تحقیقات 3b)۔ جیسا کہ پہلے روشنی ڈالی گئی ہے، ARO آبادیوں کو مضبوطی سے گروپ کیا گیا تھا، سوائے ARO12 اور ARO7 کے، جو PCOA پلاٹ میں الگ تھلگ پوزیشنوں میں نمودار ہوئے۔ دو TROs اور MCO آبادییں پلاٹ کے نیچے دائیں پینل میں بکھری ہوئی تھیں۔
چترا 3 ہے. 16 کے درمیان جینیاتی تنوع اے سیپا ان کے ایس ایس آر پروفائل کی بنیاد پر، اس مطالعے میں جن آبادی کی خصوصیات ہے۔ (a) جینیاتی فاصلے کا UPGMA ڈینڈروگرام۔ بوٹسٹریپ سپورٹ ویلیوز >50 متعلقہ نوڈس کے اوپر ظاہر کی گئی ہیں۔ (b) پرنسپل جزو تجزیہ (PCoA)۔ سرخ رنگ میں گھومنے والا کلسٹر فائیلوجنیٹک تجزیہ کے ذریعہ تیار کردہ گروپ کے ساتھ مکمل طور پر مماثل ہے اور 11 ARO رسائی کے ذریعہ تشکیل دیا گیا ہے۔
بحث
جنوبی اٹلی میں روایتی طور پر کاشت کی جانے والی زرعی حیاتیاتی تنوع کی ایک بڑی مقدار کے اندر، پیاز کی زمینیں ایسی مخصوص مصنوعات کی نمائندگی کرتی ہیں جنہیں جینیاتی کٹاؤ کے خطرے اور جدید کاشت کے متبادل کے خطرے سے محفوظ رکھنے کی ضرورت ہے۔ علاقائی پراجیکٹ BiodiversSO کے فریم ورک میں، جس کا مقصد مقامی ورثے سے مضبوطی سے جڑے ہوئے Apulia خطے کے جینیاتی وسائل کو اکٹھا کرنا، خصوصیت دینا، فروغ دینا اور ان کی حفاظت کرنا ہے، ہم نے ARO لینڈریس کی 13 آبادیوں کا ایک بیج کا مجموعہ قائم کیا۔ ہم نے ڈی این اے پولیمورفزم اور دو بائیو کیمیکل پیرامیٹرز، حل پذیر ٹھوس اور پائروک ایسڈ کے مواد کے لحاظ سے اے آر او کی تبدیلی کے پہلے جائزے کی اطلاع دی، ذائقہ کی خصوصیات سے متعلق اور تازہ کچی مصنوعات کی قبولیت کے لیے اہمیت۔ اس کے علاوہ، اے آر او لینڈریس کے اعداد و شمار کا موازنہ پیاز کے دو دیگر روغن والے لینڈریسز پر جمع کیے گئے اعداد و شمار سے کیا گیا جس کے ساتھ یہ اکثر غلطی کرتا ہے۔
میٹھی پیاز کی صنعت کے رہنما خطوط کے مطابق، حیاتیاتی کیمیائی تجزیوں نے 13 اے آر او آبادیوں کی مٹھاس کو اجاگر کیا، جو اعلیٰ حل پذیر ٹھوس مواد اور درمیانی تپش سے متعلق ہے۔ ہے [31]. ARO بلب TRO اور MCO لینڈریسز سے زیادہ میٹھے تھے، اور قدرے زیادہ تڑپ کا مظاہرہ کرتے تھے۔ تاہم، پیاز میں مٹھاس چینی کی مقدار اور تیکھی کے درمیان توازن کی وجہ سے ہوتی ہے، اس لیے یہ خصوصیت قیمت کے جینی ٹائپس کے انتخاب میں معاون ثابت ہو سکتی ہے، عام طور پر صرف فارمولوجی کی بنیاد پر کسانوں کے ذریعے کیا جاتا ہے۔
ایس ایس آر مارکروں کو جینی ٹائپس میں امتیاز کرنے کے لیے ایک کارآمد ٹول ہونے کی تصدیق کی گئی تھی، حالانکہ اکواویوا ڈیلے فونٹی کے قصبے جیسے تنگ بڑھتے ہوئے علاقے میں جمع کیے گئے تھے۔ منتخب کردہ مارکرز نے پہلے اطلاع دیے گئے مارکرز کے مقابلے میں ایللیس کی زیادہ تعداد ظاہر کی۔ ہے [43] اور ہے [44]، لیکن اس کے ذریعہ رپورٹ کردہ مارکر سے کم ہے [45]. مزید برآں، ہمارے مارکروں کے 50% سیٹ نے PIC انڈیکس کی قدریں 0.5 سے زیادہ ظاہر کیں، جو کہ مجموعہ میں آبادی کے ساتھ امتیاز کرنے کے لیے موزوں ثابت ہوئیں، جیسا کہ تجویز کردہ ہے [46]. آبادی کے اندر تنوع کی تشخیص سے Ho اور He کے درمیان یکساں اقدار کا انکشاف ہوا، جس کے نتیجے میں Fi کم ہے۔s اقدار یہ کی آؤٹ کراسنگ فطرت کے ساتھ متفق ہے اے سیپا، جو سنجیدگی سے انبریڈنگ ڈپریشن کا شکار ہے۔ ہے [47]. مجموعی طور پر Fis اس تحقیق میں پیاز کی آبادی میں شمار کی گئی قدر (0.054) اس سے کم تھی جو پہلے رپورٹ کی گئی تھی۔ ہے [45] (0.22) اور تقریباً مماثل ہے جس کے ذریعے پایا جاتا ہے۔ ہے [31] (0.08) اور ہے [48] (0.00) جس نے بالترتیب شمال مغربی اسپین اور نائجر سے پیاز کے لینڈریسز میں جینیاتی تنوع کا جائزہ لیا۔ اے آر او آبادیوں میں ہیٹروزیگوسٹی کی قابل ذکر سطح اس تصور کو تقویت دیتی ہے کہ اپولیا باغبانی کی بہت سی انواع کے لیے تنوع کے مرکز کی نمائندگی کرتی ہے۔ [32، 42، 49-ایک].
AMOVA نے روشنی ڈالی کہ اس مطالعے میں جین ٹائپ کردہ مجموعہ میں زیادہ تر سالماتی تغیر آبادی کے اندر ہے۔ تاہم، آبادی کے درمیان اہم جینیاتی تفریق (FPT اقدار) نے جینیاتی استحکام کی موجودگی کا انکشاف کیا۔ درحقیقت، اگرچہ ہمارے نتائج نے زیادہ تر ARO آبادیوں میں جینیاتی یکسانیت کی موجودگی کی نشاندہی کی، جو ایک اچھی طرح سے طے شدہ کلسٹر کی تشکیل کرتے ہوئے، ARO7 اور ARO12 آبادیوں نے واضح طور پر الگ جینیاتی پروفائل ظاہر کیا۔ یہ نتیجہ دو کسانوں کے ذریعہ استعمال ہونے والے بیجوں کی مختلف اصل کی وجہ سے ہوسکتا ہے جہاں سے آبادی جمع کی گئی تھی۔ مزید برآں، حاصل کردہ نتائج کی بنیاد پر، ARO لینڈریس کو جینیاتی سطح پر TRO اور MCO لینڈریسز سے واضح طور پر الگ سمجھا جا سکتا ہے۔ ایک حالیہ تحقیق میں، ہے [29] کئی اطالوی پیاز لینڈریسز کے جینیاتی تنوع کا جائزہ لیا جن میں "Acquaviva"، "Tropea" اور "Montoro" شامل ہیں۔ اگرچہ مصنفین نے پیاز کے وسیع ذخیرے کے جینیاتی تنوع کا اندازہ لگانے کے لیے SNP مارکر کا استعمال کیا، لیکن جین ٹائپنگ "Acquaviva" کو "Tropea" اور "Montoro" پیاز سے امتیاز کرنے کے قابل نہیں تھی۔ ممکنہ طور پر، یہ تضاد پی آئی سی کی کم اوسط قیمت (0.292) کی وجہ سے ہے، جو تجزیہ کے تحت لوکی کی معمولی عمومی معلومات کی تجویز کرتا ہے جیسا کہ دعویٰ کیا گیا ہے۔ ہے [29]. مزید برآں، ان کے اطالوی کلسٹر میں ذیلی ساخت کی موجودگی کی چھان بین کرنے کے لیے، یہ بہتر ہوتا کہ اطالوی جین ٹائپس کا بقیہ مجموعے سے الگ الگ تجزیہ کیا جائے۔ غالباً اس نے تجرباتی انتخاب کے تحت جغرافیائی سطح بندی یا خصلتوں سے منسلک جینیاتی تنوع کے نمونے کو دیکھنے کی اجازت دی ہوگی۔
آخر میں، موجودہ مطالعہ مقامی ثقافتی ورثے سے وابستہ اور کسانوں کے لیے معاشی اہمیت کے حامل پیاز کی زمین پر ایک جامع رپورٹ کی نمائندگی کرتا ہے۔ ہمارے نتائج اس بات پر روشنی ڈالتے ہیں کہ، چند مستثنیات کے ساتھ، ARO ایک اچھی طرح سے متعین جین پول کی خصوصیت رکھتا ہے، جو جینیاتی کٹاؤ کے خطرے سے محفوظ رہنے کا مستحق ہے۔ لہذا، جینیاتی تنوع کے اس قیمتی ذریعہ کے نمائندہ مجموعہ کا قیام بہت اہم رہا ہے۔ آخر میں، ARO کی جینیاتی اور فینوٹائپک خصوصیات یورپی یونین سے معیار کے نشانات حاصل کرنے کے لیے کارآمد ثابت ہو سکتی ہیں۔
معدنیات اور طریقے
جراثیم کا مجموعہ، پودوں کا مواد، اور ڈی این اے نکالنا
ARO لینڈریس کی 13 آبادیوں کا ایک سیٹ اپولیا ریجن پروجیکٹ کے فریم ورک کے اندر حاصل کیا گیا تھا (BiodiversSO: https://www.biodiversitapuglia.it/)، اٹلی کے صوبے باری کے ایک چھوٹے سے اپولیان قصبے "Acquaviva delle Fonti" میں کئے گئے مشنوں کی ایک سیریز کے ذریعے۔ جیوگرافک انفارمیشن سسٹم (GIS) کے ذریعے ہر ایکشن کی کلیکشن سائٹس کو میپ کیا گیا اور ٹیبل میں رپورٹ کیا گیا۔ 4. اس کے علاوہ، TRO لینڈریس سے دو آبادی اور MCO لینڈریس کی ایک آبادی کو موجودہ مطالعہ میں شامل کیا گیا تھا اور بطور حوالہ استعمال کیا گیا تھا۔ تمام پودوں کے مواد کو باری یونیورسٹی کے تجرباتی فارم "P Martucci" (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E) میں ایک ہی ماحولیاتی حالات میں ایک حفاظتی پنجرے کے نیچے اگایا گیا تھا تاکہ آپس میں کراس پولینیشن سے بچ سکیں۔ آبادی اور بلو فلائیز کے ذریعے آبادی کے اندر پولینیشن کو یقینی بنانا (لوسیلیا سیزر)۔ 16 آبادیوں کو بلب کے سائز اور شکل اور جلد اور گوشت کے رنگ (ٹیبل ایس 1) سے متعلق خصائل کی خصوصیت دی گئی تھی۔ اس کے علاوہ، ٹھوس حل پذیر مواد پرکھ ہاتھ سے پکڑے جانے والے ریفریکٹومیٹر کا استعمال کرتے ہوئے انجام دی گئی اور پیاز کے رس کے نمونوں میں 2,4-ڈینیٹروفینائل ہائیڈرزائن (0.125%) کا اضافہ کرتے ہوئے تیزابیت کی پیمائش کی گئی۔ v/v HCl کے 2N میں) اور 420 nm پر جاذبیت کا اندازہ لگانا، جیسا کہ رپورٹ کیا گیا ہے ہے [31]. ڈنکن کا متعدد رینج ٹیسٹ اور SNK ٹیسٹ اہم اختلافات کی موجودگی کا تعین کرنے کے لیے کیا گیا۔
ٹیبل 4. اس مطالعہ میں جمع کردہ اور جین ٹائپ شدہ آبادیوں کی فہرست۔ ہر آبادی کے لیے، شناختی کوڈ، مقامی نام، جی پی ایس کوآرڈینیٹ، اور بیجوں کو محفوظ کرنے والا جین بینک بتایا جاتا ہے۔
ضابطے | نام | GPS کوآرڈینیٹ۔ | جین بینک y |
اے آر او 1۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 2۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 3۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 4۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 5۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 6۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 7۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 8۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 9۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54'51.372″ N 16°49'3.504" E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 10۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 11۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52'49.8″ N 16°49'48.575" E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 12۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | ڈی ایس ایس پی اے |
اے آر او 13۔ | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | ڈی ایس ایس پی اے |
TRO1 | Cipolla rossa lunga di Tropea | - | ڈی ایس ایس پی اے |
TRO2 | Cipolla rossa tonda di Tropea | - | ڈی ایس ایس پی اے |
ایڈمنسٹریشن کنٹرول آفس | Cipolla ramata di Montoro | - | ڈی ایس ایس پی اے |
y Di.SSPA، ڈپارٹمنٹ آف سوائل، پلانٹ اینڈ فوڈ سائنسز، باری یونیورسٹی۔ |
فی آبادی 20 جینی ٹائپس کے پتوں کے مواد کو نمونے میں لیا گیا اور استعمال تک -80 ° C پر محفوظ کیا گیا۔ پولی سیکرائیڈ سے بھرپور پرجاتیوں کے لیے، جیسا کہ اے سیپا، اچھے معیار کے ڈی این اے کے حصول کے لیے پولی سیکرائیڈ کو ہٹانے کے پہلے اقدامات ضروری ہیں، اس لیے ایس ٹی ای بفر میں ابتدائی دھلائی (0.25 ایم سوکروز، 0.03 ایم ٹریس، 0.05 ایم ای ڈی ٹی اے) کی گئی تھی جیسا کہ بیان کیا گیا ہے۔ ہے [52]. کل ڈی این اے CTAB طریقہ کے بعد نکالا گیا تھا۔ ہے [53] اور آخر میں نینو ڈراپ 2000 UV-vis spectrophotometer (ThermoScientific, Waltham, MA, USA) اور 0.8% agarose gel electrophoresis کے ذریعے معیار اور ارتکاز کی جانچ کی گئی۔
ایس ایس آر تجزیہ
16 EST-SSR پرائمر کے مجموعے تیار کیے گئے ہیں۔ ہے [54] اور اس سے قبل جینیاتی تنوع کے مطالعے میں تجربہ کیا گیا تھا۔ ہے [43] اور ہے [44] اور 21 جینومک ایس ایس آر [45-ایک] ان کی مناسبیت کا جائزہ لینے کے لیے اسکریننگ کی گئی تھی (ضمنی جدول S4)۔ جینوٹائپنگ اقتصادی فلوروسینٹ ٹیگنگ کے طریقہ کار کا استعمال کرتے ہوئے کی گئی تھی جس میں M13 دم کو ہر فارورڈ SSR پرائمر میں شامل کیا جاتا ہے۔ ہے [56]. پی سی آر مکسز 20 جی ایل ری ایکشن میں تیار کیے گئے تھے جن میں: کل ڈی این اے کا 50 این جی، ڈی این ٹی پی مکس کا 0.2 ایم ایم، پی سی آر ری ایکشن بفر کا 1 ایکس، ڈریم ٹاک ڈی این اے پولیمریز کا 0.8 یو (تھرمو سائنٹیفک، والتھم، ایم اے، یو ایس اے)، 0.16 جی ایم ریورس پرائمر۔ , M0.032 ترتیب (13′-TGTAAAACGACGGCCAGT-5′) کے ساتھ بڑھا ہوا فارورڈ پرائمر کا 3 gM، اور FAM یا NED فلوروسینٹ رنگوں (Sigma-Aldrich, St. Louis, US) کے ساتھ لیبل لگا ہوا عالمگیر M0.08 پرائمر کا 13 gM۔ PCR کے رد عمل SimpliAmp (Applied Biosystems, CA, USA) تھرمو سائکلر میں پرائمر جوڑوں کی اکثریت کے لیے درج ذیل شرائط کے ساتھ کیے گئے: 94 منٹ کے لیے 5 ° C، 40 s کے لیے 94 ° C پر 30 سائیکل، 58 ° C 45 s اور 72 ° C کے لئے 45 s کے لئے اور 72 منٹ کے لئے 5 ° C پر آخری لمبائی۔ جہاں تک ACM446 اور ACM449 کا تعلق ہے، 60 سائیکلوں پر 55 °C سے 10 °C تک اینیلنگ کے ساتھ ٹچ ڈاؤن پی سی آر لاگو کیا گیا تھا، 30 سائیکل 55 °C پر، اس کے بعد 5 °C پر 72 منٹ کی آخری توسیع کی گئی تھی۔ پی سی آر پروڈکٹس کو 96 کنویں کی پلیٹ میں لوڈ کیا گیا اور 14 جی ایل ہائی-ڈی فارمامائڈ (لائف ٹیکنالوجیز، کارلسباد، سی اے، یو ایس اے) اور 0.5 جی ایل جین سکین 500 ROX سائز سٹینڈرڈ (لائف ٹیکنالوجیز، کارلسباد، سی اے، یو ایس اے) کے ساتھ ملایا گیا۔ ABI PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) کیپلیری سیکوینسنگ مشین کے ذریعے امپلیکسز کو حل کیا گیا، جہاں ایللیس کو کو ڈومیننٹ کے طور پر اسکور کیا گیا اور جین میپر سافٹ ویئر ورژن 3.7 کا استعمال کرکے تفویض کیا گیا۔
سافٹ ویئر GenAlEx 6.5 ہے [57] اور Cervus 3.0.7 ہے [58] ایللیس کی تعداد (Na)، موثر ایللیس کی تعداد (Ne)، مشاہدہ شدہ heterozygosity (Ho)، متوقع heterozygosity (He)، پولیمورفک انفارمیشن مواد (PIC)، شینن کا انفارمیشن انڈیکس (I)، اور فکسیشن انڈیکس (Fis) کا تخمینہ لگانے کے لیے استعمال کیا گیا تھا۔ ) ہر SSR لوکس کے لیے۔
جینیاتی تنوع کا اندازہ
پیاز کی آبادی کے درمیان اور اس کے اندر جینیاتی تغیرات کی درجہ بندی کی تقسیم کا جائزہ GenAlEx 6.5 کے ذریعے کیا گیا۔ ہے [57] 999 بوٹسٹریپنگ کے ساتھ مالیکیولر ویریئنس (AMOVA) کے تجزیہ کے ذریعے اہمیت کی جانچ کرنے کے لیے۔ مزید برآں، GenAlEx 6.5 سافٹ ویئر کا استعمال ہر آبادی کے اندر تنوع کا تخمینہ لگانے کے لیے تمام SSR لوکی پر Ho, He، اور Fis کی اوسط کا حساب لگا کر کیا گیا۔
آبادی کے ڈھانچے کا اندازہ بایسیئن ماڈل پر مبنی کلسٹرنگ الگورتھم سے لگایا گیا تھا جو STRUCTURE v.2.3.4 سافٹ ویئر میں نافذ کیا گیا تھا۔ ہے [59]. ڈیٹا سیٹ کو 1 سے 10 تک کے متعدد فرضی کلسٹرز (K) کے ساتھ چلایا گیا تھا، جس میں ہر K قدر میں دس آزاد رنز طے کیے گئے تھے۔ ہر دوڑ کے لیے، نتائج کی مستقل مزاجی کی توثیق کرنے کے مقصد سے، 100,000 ابتدائی برن ان پیریڈ اور 100,000 مارکوف چین مونٹی کارلو (MCMC) کے اعادہ کو مکسچر ماڈل اور آبادی کے درمیان آزاد ایلیل فریکوئنسی کے تحت انجام دیا گیا۔ سب سے زیادہ امکان K قدر کا تعین AK طریقہ کو نافذ کرتے ہوئے کیا گیا تھا، جس کی وضاحت کی گئی ہے۔ ہے [60]ویب پر مبنی پروگرام سٹرکچر ہارویسٹر میں ہے [61]. ایک انفرادی آبادی کو ایک مخصوص کلسٹر کے لیے تفویض کیا گیا تھا جب اس کی رکنیت کا گتانک (q-value) 0.7 سے زیادہ تھا، بصورت دیگر اسے مخلوط نسب سمجھا جاتا تھا۔
پرنسپل کوآرڈینیٹ تجزیہ Nei کے جینیاتی فاصلاتی میٹرکس (ضمنی جدول S5) کے ذریعہ انکشاف کردہ الحاق کے درمیان جینیاتی تعلق کے نمونوں کو دیکھنے کے لئے کیا گیا تھا۔ ایلیل فریکوئنسیوں کی بنیاد پر، POPTREEW سافٹ ویئر میں ریاضی کی اوسط (UPGMA) کلسٹر تجزیہ کے ساتھ غیر وزنی جوڑی گروپ کے طریقہ کار کو نافذ کرتے ہوئے جینیاتی فاصلے کا ایک ڈینڈروگرام بنایا گیا تھا۔ ہے [62]. بوٹسٹریپنگ کا اطلاق درجہ بندی کے کلسٹرنگ میں اعتماد کا اندازہ لگانے کے لیے کیا گیا تھا، ڈیٹا سیٹ کی 100 ری سیمپلنگ ترتیب دی گئی تھی۔ آخر میں، MEGA X سافٹ ویئر ہے [63] درخت ڈرائنگ سافٹ ویئر کے طور پر استعمال کیا جاتا تھا.
اضافی مواد: مندرجہ ذیل آن لائن دستیاب ہیں http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. ٹیبل S1: ARO، MCO، اور TRO بلب کی شکلی خصوصیات۔ ٹیبل S2: اے آر او لینڈریسز اور ٹی آر او اور ایم سی او لینڈریسز کے لیے ہیٹروزیگوسٹی اور فکسیشن انڈیکس کا حساب لگایا گیا ہے۔ ٹیبل S3: Fpt پیرامیٹر کی جوڑی کے لحاظ سے قدریں۔ جدول S4: مطالعہ میں استعمال ہونے والے SSRs کی فہرست۔ ٹیبل S5۔ Nei جینیاتی فاصلے کا جوڑا آبادی کا میٹرکس۔ شکل S1: K اقدار کا لائن چارٹ Evanno کے Delta K کے ساتھ تبدیل ہو رہا ہے۔
مصنف کی شراکت: CL اور LR نے مطالعہ کا تصور کیا اور تجربہ ڈیزائن کیا۔ CL اور PI نے مالیکیولر مارکر تجزیہ کیا؛ ARM اور VZ نے فیلڈ ٹرائلز کئے۔ RM، SP، GR، اور CL ڈیٹا کے تجزیہ میں شامل تھے۔ RM اور CL نے مخطوطہ لکھا۔ تمام مصنفین نے مخطوطہ کے شائع شدہ ورژن کو پڑھا اور اس سے اتفاق کیا ہے۔
فنڈ: اس کام کو علاقائی Apulian پروجیکٹ "Apulian سبزیوں کی حیاتیاتی تنوع" — Programma di Sviluppo Rural per la Puglia 2014-2020 کے ذریعے فنڈ کیا گیا تھا۔ میسورا 10-سوٹومیسورہ 10.2؛ CUP H92C15000270002، اٹلی گرانٹ کریں۔
منظوری: اعترافات تجربے میں استعمال ہونے والے پودوں کے مواد کی فراہمی کے لیے "Azienda Agricola Iannone Anna" اور "Associazione produttori della vera cipolla rossa di Acquaviva" کی وجہ سے ہیں۔
دلچسپی کے تنازعات: مصنفین کو دلچسپی کا کوئی تنازعہ نہیں ہے.
حوالہ جات
- 1. اسٹیرن، ڈبلیو ٹی ایلیم کی کتنی انواع معلوم ہیں؟ کیو میگ۔ 1992, 9، 180-182۔ [CrossRef]
- 2. فاسٹیٹ۔ FAO شماریاتی ڈیٹا بیس۔ آن لائن دستیاب: http://www.fao.org/2017 (8 جنوری 2019 کو حاصل کیا گیا)۔
- 3. بلاک، E. لہسن اور پیاز کی کیمسٹری۔ سائنس ہوں 1985, 252، 114-119۔ [CrossRef]
- 4. لی، بی؛ جنگ، جے ایچ؛ کم، ایچ ایس چوہے میں اینٹی آکسیڈینٹ سرگرمی پر سرخ پیاز کا اندازہ۔ فوڈ کیم۔ ٹاکسیکول۔ 2012, 50، 3912-3919. [CrossRef]
- 5. لی، ایس ایم؛ مون، جے؛ چنگ، جے ایچ؛ چا، وائی جے؛ شن، ایم جے چوہوں میں آرٹیریل تھرومبوسس پر کوئرسیٹن سے بھرپور پیاز کے چھلکے کے عرق کا اثر۔ فوڈ کیم۔ ٹاکسیکول۔ 2013, 57، 99-105. [CrossRef] [PubMed]
- 6. یوشیناری، او. شیوجیما، وائی۔ Igarashi, K. زکر ذیابیطس فیٹی چوہوں میں پیاز کے عرق کے انسداد موٹاپا اثرات۔ کیلوری 2012, 4,1518 1526 ہے. [CrossRef]
- 7. آکاش، MSH؛ رحمان، کے. چن، ایس اسپائس پلانٹ ایلیم سیپا: ٹائپ 2 ذیابیطس کے علاج کے لیے غذائی ضمیمہ۔ غذائیت 2014, 30، 1128-1137۔ [CrossRef] [PubMed]
- 8. وانگ، وائی؛ تیان، ڈبلیو ایکس؛ ایم اے، ایکس ایف پیاز کے روک تھام کے اثرات (ایلیم سیپا L.) فیٹی ایسڈ کی ترکیب کو روکنے کے ذریعے کینسر کے خلیوں اور ایڈیپوسائٹس کے پھیلاؤ پر نچوڑ۔ ایشیائی پیک۔ J. کینسر Prev. 2012,13، 5573-5579. [CrossRef] [PubMed]
- 9. لائی، ڈبلیو ڈبلیو؛ Hsu, SC; Chueh, FS; چن، وائی؛ یانگ، جے ایس؛ لن، جے پی؛ Lien, JC; تسائی، CH؛ چنگ، JG Quercetin NF-kappaB اور میٹرکس میٹالوپروٹینیس-2/-9 سگنلنگ پاتھ ویز کی روک تھام کے ذریعے SAS انسانی زبانی کینسر کے خلیوں کی منتقلی اور حملے کو روکتا ہے۔ اینٹی کینسر ریس. 2013, 33، 1941-1950۔ [PubMed]
- 10. نیکسترو، ایچ ایل؛ راس، SA؛ ملنر، جے اے لہسن اور پیاز: ان کے کینسر سے بچاؤ کی خصوصیات۔ کینسر Prev. Res. 2015, 8,181 189 ہے. [CrossRef]
- 11. فورٹ، ایل. Torricelli، P.؛ بوانینی، ای. Gazzano، M.؛ روبینی، K.؛ Fini، M.؛ بگی، اے. کوئرسیٹن فنکشنلائزڈ ہائیڈروکسیپیٹائٹ کے اینٹی آکسیڈینٹ اور ہڈیوں کی مرمت کی خصوصیات: ایک ان وٹرو آسٹیو بلاسٹ-اوسٹیو کلاسسٹ-اینڈوتھیلیل سیل کو کلچر اسٹڈی۔ ایکٹا بائیو میٹر۔ 2016, 32، 298-308. [CrossRef]
- 12. یامازاکی، Y.؛ Iwasaki, K.; میکامی، ایم؛ یاگیہاشی، A. سات ایلیم سبزیوں میں گیارہ ذائقہ کے پیشگی، S-Alk(en)yl-L-cysteine کے مشتقات کی تقسیم۔ فوڈ سائنس۔ ٹیکنالوجی. Res. 2011, 17، 55-62. [CrossRef]
- 13. بلاک، ای. جینس ایلیم کی آرگنسلفر کیمسٹری — سلفر کی نامیاتی کیمسٹری کے لیے مضمرات۔ اینجیو کیم انٹر ایڈ انگلش 1992, 31، 1135-1178۔ [CrossRef]
- 14. گریفتھس، جی۔ Trueman, L.; کروتھر، ٹی. تھامس، بی؛ اسمتھ، بی پیاز- صحت کے لیے ایک عالمی فائدہ۔ فائٹوتھر۔ Res. 2002,16، 603-615. [CrossRef]
- 15. Schwimmer, S.; ویسٹن، ڈبلیو جے پیاز میں پائروک ایسڈ کی انزائیمیٹک نشوونما کے طور پر پیاز کی پیمائش۔ جے ایگرک فوڈ کیم۔ 1961, 9، 301-304. [CrossRef]
- 16. کیٹر، کیٹ؛ رینڈل، پیاز میں ڈبلیو ایم پنگینسی کی تشخیص۔ میں تجربہ گاہوں کی تعلیم کے لیے ٹیسٹ شدہ مطالعہ؛ کارچر، ایس جے، ایڈ۔ ایسوسی ایشن فار بائیولوجی لیبارٹری ایجوکیشن (قابل): نیویارک، نیویارک، امریکہ، 1998؛ جلد 19، صفحہ 177-196۔
- 17. ہینیلٹ، پی ٹیکسانومی، ارتقاء، اور تاریخ۔ میں پیاز اور اس سے منسلک فصلیں، جلد۔ I. نباتیات، فزیالوجی اور جینیات؛ Rabinowitch, HD, Brewster, JL, Eds.; CRC پریس: Boca Raton, FL, USA, 1990; صفحہ 1-26۔
- 18. Rabinowitch, HD; کراہ، ایل. ایلیم کراپ سائنس: حالیہ پیشرفت؛ CABI پبلشنگ: والنگ فورڈ، یوکے، 2002۔
- 19. مالور، سی.؛ Carravedo، M.؛ ایسٹوپنان، جی؛ مالور، F. پیاز کے جینیاتی وسائل کی خصوصیت (ایلیم سیپا L.) ہسپانوی ثانوی مرکز تنوع سے۔ اسپین جے ایگرک Res. 2011, 9، 144-155۔ [CrossRef]
- 20. فیریولی، ایف۔ D'Antuono، اٹلی اور یوکرین سے مقامی پیاز اور شلوٹ جرمپلازم میں فینولکس اور سیسٹین سلفوکسائڈز کی LF تشخیص۔ جینیٹ ریسور فصل ارتقاء۔ 2016, 63، 601-614. [CrossRef]
- 21. پیٹروپولوس، SA؛ فرنینڈس، اے. Barros, L.; فریرا، آئی سی ایف آر؛ Ntatsi, G. یونان سے پیاز کی ایک مقامی لینڈریس 'واٹیکیوٹیکو' کی مورفولوجیکل، غذائیت اور کیمیائی تفصیل۔ فوڈ کیم۔ 2015,182، 156-163۔ [CrossRef]
- 22. لیگوری، ایل. Adiletta, G.; نظرو، ایف۔ Fratianni، F.؛ ڈی میٹیو، ایم؛ البانی، ڈی بائیو کیمیکل، اینٹی آکسیڈنٹ خصوصیات اور بحیرہ روم کے علاقے میں پیاز کی مختلف اقسام کی اینٹی مائکروبیل سرگرمی۔ J. فوڈ میس۔ کردار 2019,13، 1232-1241۔ [CrossRef]
- 23. یو، کے ایس؛ پائیک، ایل. کروسبی، K.؛ جونز، آر. Leskovar, D. کھیتی، ترقی کے ماحول، اور بلب کے سائز کی وجہ سے پیاز کی تپش میں فرق۔ سائنس ہارٹک۔ 2006,110، 144-149۔ [CrossRef]
- 24. بیسک، این. پرنر، ایچ. شوارز، ڈی۔ جارج، ای. کروہ، ایل ڈبلیو؛ Rohn, S. quercetin-3، 4′-O-diglucoside، quercetin-4′-O-monoglucoside، اور quercetin کی تقسیم پیاز کے بلب کے مختلف حصوں میں (Allium cepa L.) جین ٹائپ سے متاثر ہے۔ فوڈ کیم۔ 2010,122، 566-571. [CrossRef]
- 25. Caruso, G.; کونٹی، ایس. ولاری، جی؛ بوریلی، سی. میلچیونا، جی؛ منٹولو، ایم. روسو، جی؛ Amalfitano، C. پیاز کی پیداوار، معیار اور اینٹی آکسیڈینٹ مواد پر پیوند کاری کے وقت اور پودوں کی کثافت کے اثرات (ایلیم سیپا L.) جنوبی اٹلی میں۔ سائنس ہارٹک۔ 2014,166، 111-120۔ [CrossRef]
- 26. پیریز-گریگوریو، ایم آر؛ Regueiro, J.; سیمل گندارا، جے۔ Rodrigues, AS; المیڈا، ڈی پی ایف اینٹی آکسیڈینٹ فلاوونائڈز کے ذریعہ پیاز کی اضافی قدر میں اضافہ: ایک تنقیدی جائزہ۔ ضابطہ اخلاق ریورس. فوڈ سکی. نیوٹر. 2014, 54،1050 1062 ہے. [CrossRef] [PubMed]
- 27. Pohnl, T.; Schweiggert, RM; کارلے، آر. پیاز میں حل پذیر کاربوہائیڈریٹس اور تیکھی اصولوں پر کاشت کے طریقہ کار اور کاشتکاری کے انتخاب کا اثر (ایلیم سیپا ایل)۔ جے ایگرک فوڈ کیم۔ 2018, 66، 12827-12835۔ [CrossRef] [PubMed]
- 28. ٹیڈیسکو، I.؛ کاربون، وی. Spagnuolo, C.; میناسی، پی. روسو، جی ایل کی دو جنوبی اطالوی اقسام سے فلیوونائڈز کی شناخت اور مقدار الیمیم سیپا L.، Tropea (سرخ پیاز) اور Montoro (تانبے کا پیاز)، اور انسانی erythrocytes کو آکسیڈیٹیو تناؤ سے بچانے کی ان کی صلاحیت۔ جے ایگرک فوڈ کیم۔ 2015, 63، 5229-5238. [CrossRef]
- 29. ویلانو، سی. Esposito, S.; Carucci, F.; Frusciante, L.; کارپوٹو، ڈی۔ Aversano, R. پیاز میں ہائی تھرو پٹ جین ٹائپنگ جینیاتی تنوع اور مالیکیولر افزائش کے لیے مفید SNPs کی ساخت کو ظاہر کرتی ہے۔ مول نسل. 2019, 395. [CrossRef]
- 30. Mercati، F.؛ لانگو، سی۔ پوما، ڈی۔ Araniti, F.; Lupini, A.; ممانو، ایم ایم؛ فیور، ایم سی؛ Abenavoli, MR; سنسیری، ایف ایک اطالوی طویل شیلف لائف ٹماٹر کا جینیاتی تغیر (سولانم لائکوپرسکم L.) SSR اور مورفولوجیکل پھل کی خصوصیات کا استعمال کرتے ہوئے جمع کرنا۔ جینیٹ ریسور فصل ارتقاء۔ 2014, 62، 721-732. [CrossRef]
- 31. گونزالیز پیریز، ایس. مالور، سی. Garces-Claver, A.; میرینو، ایف۔ Taboada, A.; رویرا، اے. پومر، ایف. پیرووک، ڈی. سلور، C. پیاز کے مجموعے میں جینیاتی تنوع اور معیار کی خصوصیات کی تلاش (ایلیم سیپا L.) شمال مغربی اسپین سے لینڈریسز۔ جینیاتیات 2015, 47، 885-900. [CrossRef]
- 32. لوٹی، سی.؛ Iovieno، P.؛ Centomani، I.؛ Marcotrigiano, AR; فینیلی، وی. Mimiola, G.; سمو، سی. پاون، ایس. Ricciardi، L. جینیاتی، حیاتیاتی زرعی، اور کیلے کی غذائیت کی خصوصیات (براسیکا اولیریسا۔ L. var acephalaاپولیا، جنوبی اٹلی میں تنوع۔ تنوع 2018,1025. [CrossRef]
- 33. بردارو، این. Marcotrigiano, AR; بریکوٹو، وی. Mazzeo, R.; Ricciardi, F.; لوٹی، سی. پاون، ایس. Ricciardi، L. مزاحمت کا جینیاتی تجزیہ Orobanche crenata (فورسک) ایک مٹر میں (پیسم سیٹیوم L.) کم اسٹریگولاکٹون لائن۔ J. پلانٹ پاتھول۔ 2016, 98، 671 675 ہے.
- 34. واکو، ٹی۔ سوکازاکی، ایچ۔ Yaguchi, S.; یاماشیتا، K.؛ Ito, S.; شگیو، ایم. پیاز کے گچھے میں بولٹنگ ٹائم کے لیے مقداری خاصیت کی لوکی کی نقشہ سازی (ایلیم فسٹولوسم ایل)۔ یوفیٹیکا 2016, 209، 537-546. [CrossRef]
- 35. ڈھاکہ، این. مکوپادھیائے، اے۔ پرتوش، کے. گپتا، وی. پینٹل، ڈی. پردھان، اے کے جینک ایس ایس آر کی شناخت اور ایس ایس آر پر مبنی لنکیج میپ کی تعمیر Brassica juncea. یوفیٹیکا 2017, 213، 15. [CrossRef]
- 36. آنندھن، ایس. Mote, SR; گوپال، جے. ایس ایس آر مارکر کا استعمال کرتے ہوئے پیاز کی مختلف قسم کی شناخت کی تشخیص۔ بیج سائنس ٹیکنالوجی. 2014, 42، 279-285. [CrossRef]
- 37. Mitrova, K.; Svoboda، P.؛ Ovesna, J. جمہوریہ چیک سے پیاز کی کھیتی کے فرق کے لیے مارکر سیٹ کا انتخاب اور توثیق۔ چیک جے جینیٹ۔ پودوں کی نسل۔ 2015, 51، 62-67. [CrossRef]
- 38. ڈی رینزو، وی. میازی، ایم ایم؛ فینیلی، وی. سبیتا، ڈبلیو. مونٹیمورو، سی. اپولین زیتون کے جراثیمی حیاتیاتی تنوع کا تحفظ اور خصوصیت۔ ایکٹا ہارٹک۔ 2018,1199،1 6 ہے. [CrossRef]
- 39. مالور، سی.؛ آرنیڈو-اینڈریس، اے. Garces-Claver, A. ہسپانوی کے جینیاتی تنوع کا اندازہ لگانا الیمیم سیپا مائیکرو سیٹلائٹ مارکر کا استعمال کرتے ہوئے پیاز کی افزائش کے لیے لینڈریس۔ سائنس ہارٹک۔ 2014,170، 24-31۔ [CrossRef]
- 40. Rivera, A.; مالور، سی. Garces-Claver, A.; گارسیا اللو، اے. پومر، ایف. سلور، سی پیاز میں جینیاتی تنوع کا اندازہ لگانا (الیمیم سیپا L.) شمال مغربی اسپین سے لینڈریسز اور یورپی تغیر کے ساتھ موازنہ۔ NZJ فصل ہارٹک۔ 2016, 44، 103-120۔ [CrossRef]
- 41. ڈی جیوانی، سی.؛ پاون، ایس. ترانٹو، ایف۔ ڈی رینزو، وی. میازی، ایم ایم؛ Marcotrigiano, AR; منگینی، جی؛ مونٹیمورو، سی۔ Ricciardi, L.; لوٹی، C. چنے کے عالمی جراثیم کے مجموعہ کا جینیاتی تغیر (Cicer arietinum L.) بشمول جینیاتی کٹاؤ کے خطرے میں اطالوی رسائی۔ فزیول مول بائول پودے 2017, 23، 197-205۔ [CrossRef]
- 42. مازیو، آر. Morgese, A.; سوننتے، جی؛ زولوگا، ڈی ایل؛ پاون، ایس. Ricciardi, L.; لوٹی، سی. بروکولی ریب میں جینیاتی تنوع (براسیکا ریپا ایل سب ایس پی سلویسٹریس (L.) Janch.) جنوبی اٹلی سے۔ سائنس ہارٹک۔ 2019, 253، 140-146۔ [CrossRef]
- 43. جاکس، ایم. مارٹن، ڈبلیو. McCallum, J.; ہیوی، ایم. سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم، انڈیلز، اور سادہ ترتیب پیاز کی کاشت کی شناخت کے لیے دہرائی جاتی ہے۔ جے ایم Soc ہارٹک۔ سائنس 2005,130، 912-917. [CrossRef]
- 44. میک کیلم، جے۔ تھامسن، ایس. پیتھر جوائس، ایم؛ کینیل، ایف. جینیاتی تنوع کا تجزیہ اور کاشت شدہ بلب پیاز میں سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم مارکر کی نشوونما جس کی بنیاد پر ظاہر کردہ ترتیب ٹیگ-سادہ ترتیب دوبارہ مارکر ہے۔ جے ایم Soc ہارٹک۔ سائنس 2008,133، 810-818. [CrossRef]
- 45. بالڈون، ایس. پیتھر جوائس، ایم؛ رائٹ، K.؛ چن، ایل. میک کیلم، J. بلب پیاز کے اندر اور ان کے درمیان جینیاتی تنوع کے تخمینے کے لیے مضبوط جینومک سادہ سیکونس ریپیٹ مارکر کی ترقی (ایلیم سیپا L.) آبادی مول نسل. 2012, 30، 1401-1411۔ [CrossRef]
- 46. ڈی ووڈی، جے اے؛ ہنی کٹ، آر ایل؛ اسکو، LC مائیکرو سیٹلائٹ مارکر سفید دم والے ہرن میں۔ جے یہاں۔ 1995, 86، 317 319 ہے. [CrossRef] [PubMed]
- 47. خدادادی، ایم. حسن پنہ، ڈی ایرانی پیاز (ایلیم سیپا ایل۔ ورلڈ ایپل۔ سائنس جے۔ 2010,11، 426-428.
- 48. عبدو، آر. Bakasso, Y.; سعدو، ایم. Baudoin، JP؛ ہارڈی، OJ نائجر پیاز کی جینیاتی تنوع (ایلیم سیپا ایل۔ ایکٹا ہارٹک۔ 2016,1143، 77 90 ہے. [CrossRef]
- 49. پاون، ایس. لوٹی، سی. Marcotrigiano, AR; Mazzeo, R.; بردارو، این۔ بریکوٹو، وی. Ricciardi, F.; ترانٹو، ایف۔ D'Agostino، N.؛ شیاوولی، اے. ET رحمہ اللہ تعالی. کاشت شدہ چنے میں ایک الگ جینیاتی جھرمٹ جیسا کہ جینوم وسیع مارکر کی دریافت اور جین ٹائپنگ سے ظاہر ہوتا ہے۔ پلانٹ جینوم 2017, 2017،10. [CrossRef]
- 50. پاون، ایس. Marcotrigiano, AR; سیانی، ای. Mazzeo, R.; Zonno, V.; Ruggieri, V.; لوٹی، سی. Ricciardi، L. ایک خربوزے کی جینو ٹائپنگ کے لحاظ سے ترتیب (کیومیس میلو ایل۔ بی ایم سی جینوم۔ 2017, 1859. [CrossRef]
- 51. Di Rienzo, V.; سیون، ایس. ترانٹو، ایف۔ D'Agostino، N.؛ مونٹیمورو، سی۔ فینیلی، وی. سبیتا، ڈبلیو. Boucheffa, S.; تمندجاری، اے. Pasqualone, A.; ET رحمہ اللہ تعالی. بحیرہ روم کے طاس کے اندر زیتون کی آبادی میں جینیاتی بہاؤ۔ پیر جے۔ 2018, 6. [CrossRef]
- 52. چرواہا، LD؛ میکلے، ٹی جی پولی سیکرائیڈ سے بھرپور پودوں کے بافتوں سے ڈی این اے کو الگ کرنے کے لیے دو مائیکرو اسکیل پروٹوکول۔ J. پلانٹ Res. 2011,124، 311-314. [CrossRef]
- 53. ڈوئل، جے جے؛ ڈوئل، JL تازہ بافتوں سے پودوں کے ڈی این اے کی تنہائی۔ توجہ مرکوز 1990,12، 13-14۔
- 54. کوہل، جے سی؛ چیونگ، ایف۔ Qiaoping, Y.; مارٹن، ڈبلیو. Zewdie, Y.; McCallum, J.; Catanach, A.; ردرفورڈ، پی. سنک، KC؛ جینڈریک، ایم؛ ET رحمہ اللہ تعالی. 11,008 پیاز کے اظہار کردہ ترتیب والے ٹیگز کا ایک انوکھا سیٹ مونوکوٹ آرڈرز asparagales اور poales کے درمیان اظہار ترتیب اور جینومک فرق کو ظاہر کرتا ہے۔ پلانٹ سیل 2004,16، 114-125. [CrossRef]
- 55. کم، ایچ جے؛ لی، HR؛ Hyun, JY; گانا، KH؛ کم، کے ایچ؛ کم، جے ای؛ حور، سی جی؛ ہارن، ایس ایس آر فائنڈر کا استعمال کرتے ہوئے پیاز کی جینیاتی پاکیزگی کی جانچ کے لیے CH مارکر کی ترقی۔ کوریائی جے نسل۔ سائنس 2012, 44، 421-432. [CrossRef]
- 56. Schuelke, M. PCR کے ٹکڑوں کی فلوروسینٹ لیبلنگ کے لیے ایک اقتصادی طریقہ۔ نیٹ بائیو ٹیکنالوجی 2000, 18، 233-234. [CrossRef] [PubMed]
- 57. پیکال، آر. Smouse, PE GenAlEx 6.5: ایکسل میں جینیاتی تجزیہ۔ تعلیم اور تحقیق کے لیے پاپولیشن جینیاتی سافٹ ویئر: ایک اپ ڈیٹ۔ بایو انفارمیٹکس 2012, 28، 2537-2539. [CrossRef] [PubMed]
- 58. Kalinowski, ST; ٹیپر، ایم ایل؛ مارشل، TC کمپیوٹر پروگرام CERVUS جینی ٹائپنگ کی غلطی کو کیسے ایڈجسٹ کرتا ہے اس پر نظر ثانی کرنا پیٹرنٹی اسائنمنٹ میں کامیابی کو بڑھاتا ہے۔ مول ایکول 2007,16، 1099-1106۔ [CrossRef]
- 59. پرچرڈ، جے کے؛ سٹیفنز، ایم. روزنبرگ، این اے؛ ڈونیلی، پی ایسوسی ایشن کی تشکیل شدہ آبادیوں میں نقشہ سازی۔ ایم۔ جے ہم جینیٹ 2000, 67، 170 181 ہے. [CrossRef]
- 60. ایوانو، جی؛ ریگناٹ، ایس. Goudet, J. سافٹ ویئر استعمال کرنے والے افراد کے کلسٹرز کی تعداد کا پتہ لگانا ساخت: ایک نقلی مطالعہ۔ مول ایکول 2005,14، 2611-2620. [CrossRef]
- 61. ارل، ڈی. VonHoldt, B. سٹرکچر ہارویسٹر: سٹرکچر آؤٹ پٹ کو دیکھنے اور ایوانو طریقہ کو نافذ کرنے کے لیے ایک ویب سائٹ اور پروگرام۔ محفوظ کرنا۔ جینیٹ ریسور 2011, 4. [CrossRef]
- 62. تاکیزاکی، این۔ نی، ایم؛ Tamura, K. POPTREEW: POPTREE کا ویب ورژن ایلیل فریکوئنسی ڈیٹا سے آبادی کے درختوں کی تعمیر اور کچھ دیگر مقداروں کی کمپیوٹنگ کے لیے۔ مول بائول۔ ارتقاء 2014, 31، 1622 1624 ہے. [CrossRef]
- 63. کمار، ایس. سٹیچر، جی؛ لی، ایم؛ کنیز، سی. تمورا، K. MEGA X. کمپیوٹنگ پلیٹ فارمز میں مالیکیولر ایوولیوشنری جینیٹکس تجزیہ۔ مول بائول۔ ارتقاء 2018, 35، 1547-1549۔ [CrossRef]