محققین نے نئی ہائی تھرو پٹ اسٹیبل آئسوٹوپ پروبنگ (HT-SIP) پائپ لائن اور میٹاجینومکس کا استعمال کیا تاکہ ایک فائدہ مند پودوں کی علامت، arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) کے ارد گرد موجود فعال مائکرو بایوم پر پہلی نظر ڈالی جا سکے۔ کریڈٹ: لارنس لیورمور نیشنل لیبارٹری
جنگلی جرثوموں کی شناخت کو ان کے جسمانی خصائص اور ماحولیاتی افعال سے جوڑنا ماحولیاتی مائکرو بایولوجسٹ کا ایک اہم مقصد ہے۔ اس مقصد کے لیے کوشش کرنے والی تکنیکوں میں سے، مستحکم آاسوٹوپ پروبنگ—SIP — کو قدرتی ماحول میں فعال مائکروجنزموں کا مطالعہ کرنے کے لیے سب سے مؤثر سمجھا جاتا ہے۔
لارنس لیورمور نیشنل لیبارٹری (LLNL) کے سائنسدانوں نے ایک نئی تکنیک تیار کی ہے — ہائی تھرو پٹ SIP — جو مستحکم آاسوٹوپ پروبنگ کے عمل میں کئی مراحل کو خود کار بناتی ہے، جس سے لیب کلچرنگ کی ضرورت کے بغیر، حقیقت پسندانہ حالات میں مائکروجنزموں کی مائکروبیل سرگرمی کی تحقیقات کی اجازت ملتی ہے۔
ایس آئی پی میں، فعال جرثوموں کی شناخت ان کے بایوماس میں مستحکم آاسوٹوپس کو شامل کرنے کے ذریعے کی جاتی ہے۔ یہ مائکروبیل ایکولوجی کے سب سے طاقتور طریقوں میں سے ہے کیونکہ یہ مقامی حالات میں پیچیدہ کمیونٹیز میں فعال جرثوموں اور ان کے جسمانی خصائص (سبسٹریٹ استعمال، سیلولر بائیو کیمسٹری، میٹابولزم، نمو، شرح اموات) کی شناخت کر سکتا ہے۔
عام طور پر، ایس آئی پی کے طریقہ کار کے لیے کافی محنت کی ضرورت ہوتی ہے اور یہ صرف نمونوں کی ایک چھوٹی سی تعداد کی اجازت دیتا ہے۔ لیکن نئی LLNL تکنیک میں دستی ایس آئی پی کے مقابلے ایک چھٹے حصے کی محنت کی ضرورت ہوتی ہے اور یہ 16 نمونوں کو بیک وقت پروسیس کرنے کی اجازت دیتی ہے۔
"ہمارا نیم خودکار طریقہ کار آپریٹر کے وقت کو کم کرتا ہے اور SIP کے انتہائی محنتی اقدامات کو نشانہ بنا کر تولیدی صلاحیت کو بہتر بناتا ہے،" LLNL کے سائنسدان ایرن نیوسیو، اور جرنل مائکروبیوم میں شائع ہونے والے ایک مقالے کے مرکزی مصنف نے کہا۔ "اب ہم نے اس نقطہ نظر کو ایک ہزار سے زیادہ نمونوں پر کارروائی کرنے کے لیے استعمال کیا ہے، جن میں سے کچھ بہت کم زیر تعلیم مٹی کے مائیکرو ہیبیٹیٹس سے ہیں۔"
ایسی ہی ایک مائیکرو ہیبی ٹیٹ وہ مٹی ہے جو فوری طور پر mycorrhizae کے ٹشوز کے اردگرد ہوتی ہے - ایک قسم کی فنگس جو تمام زمینی پودوں کے 72% کے ساتھ علامتی تعلقات بناتی ہے۔ پودوں کے کاربن کے بدلے، فنگس (آربسکولر مائیکورریزل فنگس) اپنے میزبانوں کو ضروری وسائل جیسے نائٹروجن، فاسفورس اور پانی فراہم کرتی ہے۔
تصور کے اس ثبوت کے مطالعہ میں، مصنفین نے مٹی میں مائیکورریزل فنگس کے ذریعے متحرک ہونے والے تعاملات کا "فوڈ ویب" دکھایا۔
"ہمارے خیال میں یہ ایک اہم راستہ ہے کہ کس طرح پودوں کی کاربن مٹی میں وسیع پیمانے پر تقسیم ہوتی ہے۔ مٹی کرہ ارض پر نامیاتی کاربن کو فعال طور پر سائیکل کرنے کا سب سے بڑا تالاب رکھتی ہے،" شریک متعلقہ مصنف جینیفر پیٹ-ریج نے کہا، جو LLNL پروجیکٹ کی سربراہ اور محکمہ توانائی کے دفتر برائے سائنس کی سربراہ ہیں "مائکروبس پرسسٹ" Soil Microbiome Scientific Focus Area . "ہم نے ڈی این اے کی ایک چھوٹی سی مقدار کو ترتیب دیا، فعال حیاتیات کا تعین کیا اور پھر ان کے جینوم اور ممکنہ تعاملات کو دوبارہ تشکیل دیا۔"
ایل ایل این ایل کے دیگر مصنفین میں اسٹیون بلیز وِکز، ماریسا لافلر، ایشلے کیمبل، جیفری کمبریل، جیسیکا ولارڈ، ریچل ہیسٹرین کے ساتھ ساتھ لارنس برکلے نیشنل لیبارٹری، ڈی او ای جوائنٹ جینوم انسٹی ٹیوٹ اور یونیورسٹی آف کیلیفورنیا، برکلے کے محققین شامل ہیں۔